Αν θα θέλαμε να μιλήσουμε θεωρητικά, για να μη μολυνθεί κανείς από οποιονδήποτε HPV, πρέπει να μην έρθει σε επαφή με μολυσμένο άτομο. Δεν μπορούμε να γνωρίζουμε όμως με ακρίβεια εάν κάποιος έχει μολυνθεί παλαιότερα. Στους περισσότερους ανθρώπους, οι αλλοιώσεις που προκαλούνται από τους HPV δεν είναι εμφανείς και δεν προκαλούν συμπτώματα. Είναι συνήθως υποκλινικές (μη ορατές από τους ασθενείς), αλλά και από το γιατρό (αν μιλάμε για απλή κλινική εξέταση, με γυμνό μάτι). Επίσης, δεν υπάρχει αξιόπιστη μέθοδος ρουτίνας για ανίχνευση των αντισωμάτων από HPV-μόλυνση στο αίμα.
Με βάση τα ανωτέρω, επιτυχής πρόληψη μπορεί να γίνει μόνο εάν εμβολιαστεί κάποιος προτού μολυνθεί.